Estimados colegas:
Lamentablemente, aun siguiendo el manual que da el Ministerio, siempre estará sujeto a que se le hagan observaciones.
Recuerde que cada Reglamento tendrá sus particularidades propias y siempre habrán disposiciones diferentes. Debe tener en cuenta además que los reglamentos son revisados por colaboradores diferentes, y cada uno tendrá un criterio propio. Es la dificultad de no tener unificados los criterios aplicables.
Lo que le recomendaría es que si ya ha presentado el reglamento y le hacen mas de un pliego de observaciones, soliciten hablar con el Jefe de la sección de Reglamento Internos y le exponga la situación.
Solo como un comentario adicional, nosotros hemos presentados muchos reglamentos internos, y siempre hemos utilizado la misma plantilla de un reglamento ya aprobado por la Dirección General, pero siempre nos hacen observaciones, aunque sean de forma y que no fueron observados en el aprobado.
Ármese de paciencia colega porque solo eso nos queda.