Creo que el error fue el orden en que se interpusieron las pretensiones.
La demanda tuvo que ser de reconocimiento judicial de paternidad, indemnizaciòn por daño moral y alimentos.
Y en la misma demanda como pretensiòn y por tratarse del mismo demandado, debiò mencionarse que se pretendìa iniciar una demanda de alimentos.
Debe revisarse el poder con el cual comparece la madre a representar a sus hijos.
Si se hizo de esa manera, lo mejor es interponer apelaciòn ante la declaratoria de inadmisibilidad.
Podrìa tambien plantear las pretensiones al revès: primero los alimentos por el hijo que esta reconocido y en otra separada dentro de la misma demanda la declaratoria judicial de paternidad.
El error que suele cometerse es que no se separan las pretensiones; porque si en su caso se plantearon los alimentos para ambos hijos, para uno no le habìa nacido el derecho; y como la pretensiòn principal eran los alimentos, tuvieron que haberle prevenido y usted, subsanado haciendo la separaciòn de las pretensiones.- Entonces al no cumplr la prevenciòn conforme a los requerimientos del tribunal suelen declarar no ha lugar por no haber evacuado las prevenciones.
Habrìa que revisar si en el caso planteado sucediò que no se hizo la separaciòn de las pretensiones. Si es asì sugiero se ordene la demanda y se planteen nuevamente las pretensiones separadas.
Suerte...