Perfectamente podés hacer la escritura tal como está, es decir, relacionando el número de inscripción y libro de propiedad en el que está inscrita. Al hacer el proceso de inscripción en el CNR, ellos hacen la migración de la inscripción, es decir, que la pasan del sistema de libros, al sistema computarizado SIRYC. Tu no tienes que hacer nada para que hagan esa migración, solo presentar la compraventa a inscripción, y al inscribirla ellos le asignarán un número de matrícula.
La extractada puede serte de mucha utilidad para conocer si el inmueble está libre de gravamen. Además deberías de verificar que no tenga presentaciones en trámite, como por ejemplo una hipoteca, embargo, desmembración, etc; ya que a veces aunque no estén inscritas, quedan presentadas (si son viejas) y por principio de prioridad no le dan paso a tu compraventa, sino hasta que esos documentos presentados son corregidos en sus observaciones o retirados sin inscribir.
Ya una vez me paso eso. Hice una compraventa y aparecía libre el inmueble, pero tenía una presentación de una hipoteca, desde hacía como 26 años, pero no había sido inscrita por estar observada y no la habían subsanado, y eso no le daba paso a mi compraventa, al final logré resolver el problema solicitando un retiro sin inscribir de esa hipoteca, por parte del notario que la había hecho, pues la ley anterior permitía que el notario pudiera hacer eso.
Suerte! Saludos!
Meayala